绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱已经完成
绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱已经完成
绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图新商盟谱已经由中国烟草完成。这是全球第一套烟草全基因组序列图谱，也是继马铃薯和番茄基因组之后全球完成的第三种茄科植物全基因组序列图谱。该绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱是目前已知植物基因组序列图谱中基因组最大、组装精度最高、组装结果最好的2个图谱。绒毛状烟草和林烟草是栽培烟草的两个祖先种，绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱的完成，具有重要的科学价值和战略意义，将开创烟草科学研究和技术发展的新纪元，是烟草科学发展的一个重要里程碑，标志着烟草研究从此全面进入基因组时代。
绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱是中国烟草同世界上测序能力最强、最具权威的基因组测序机构合作完成。根据烟草基因组重复序列含量较高和基因组较大等特点，通过Illumina第二代高通量测序技术，采用全基因组鸟枪法（WGS）结合构建细菌人工染色体（BAC to BAC）策略进行测序和组装工作。利用全基因组鸟枪法（WGS）策略构建不同长度的插入片段文库进行双末端测序和组装，同时选取一定基因组覆盖度的BAC克隆，对BAC克隆进行测序和组装，然后将两种数据结合进行深度组装，最终获得高质量烟草全基因组序列图谱，实现对单碱基的高深度重复测序，保证单碱基的高准确率。经数据分析，获得绒毛状烟草和林烟新商盟网上订烟草基因组大小均为2.4Gb，基因组常染色质区覆盖度达到95%以上，基因区覆盖度达到98%以上，获得的全基因组序列图谱（第一版）contig N50超过20kb，scaffold N50超过350kb，全面达到国际公认高质量精细图谱标准，是目前已知植物基因组序列图谱中基因组最大、组装精度最高、组装结果最好的2个图谱，居世界领先地位。根据目前工作基础，预计在年底前可获得序列图谱（第二版），预计scaffold N50将达到1M以上，较第一版图谱有显著提高。
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