日本对中国船从来很敏感
其实每次中国军舰甚至科学考察船接近日本领海，都会引起日本强烈的反响。日本防卫厅连续几年发表的《防务白皮书》都有这一句：“中国海军舰艇频繁出没于日本近海，对日本构成了威胁。”2003年11月，中国“明”级攻击型潜艇在日本附近海域出现，并浮出水面，日本舆论认为，这是中国向日本“示威”，“为反制日本介入未来可能的台海战争”。
2004年，中国的“汉”级攻击型核潜艇误入接近台湾海域的日本领海。日本政府发出了海上自卫队创设以来的第二次海上警备行动命令。日本外相召见中国驻日公使，提出“强烈抗议，并要求道歉”。几天后，中国外交部向日方通报了潜艇进入冲绳水域事件，并称事件已得到妥善解决。
但有些日本关于中国舰只误入领海的指责，也被中方所否定。2008年9月，日本在高知县发现国籍不明的潜艇侵入其领海，称其为“中国的潜艇”。中国外交部否认是本国的潜艇，并对日本将此潜艇与中国挂钩表示遗憾。
冲绳是一个敏感地区，它位于日本西南端，曾经是中国的属地，直到19世纪后期被日本强行吞并。它是美国第一岛链的重要环节，既靠近美国主要军事基地，又距离中国领土最近，冲绳县的与那国岛离台湾岛110公里，逢晴朗天气，两岛可肉眼相望。
冲绳在日本的地位十分特殊，去冲绳很不容易，需要专门申请。冲绳的机场虽然是国内机场，但竟有海关和免税店。日本有意将冲绳打造成“日本冲向亚洲的前沿”。日本还与沙特在冲绳搞了石油储备库。
专家：也许与核峰会有关
旅居中国的日本媒体人士加藤嘉一13日对《环球时报》记者说：事发地点靠近冲绳，对日本国土有一定的威胁感，媒体不能不报。但他认为日本媒体的反应“看不到炒作的成分”。加藤说，这次毕竟是在公海，并没有违反国际法，也不是“入侵”。日方发现中国军舰在靠近日本的公海出现，这是一个动态而非摩擦。他从一名外交官处得知，日本已通过外交途径向中国进行询问，是以一种“非常冷静随和的方式”进行的，这说明两国外交日益成熟。“这事如果发生在2005年，那就糟糕了”。
中国现代国际关系研究院研究员刘军红13日对《环球时报》记者说，中国军舰在公海上行驶，日本是完全挑不出理的，但这次不只日本媒体说，连防卫大臣都出来说，这显然有些借题发挥。如果联系当前的核峰会，就不难明白日本的意图。此次美俄都在削减核武器上做了姿态，这打破了日本长期以来靠大国平衡维持自身安全的理念，首先日本自身就希望中国在军力削减上做出姿态，所以在这个时刻突出“中国军事威胁”，另外，美国也希望中国跟随美俄削减核武器，不排除日本在此时配合美国营造外围舆论的可能性。
刘军红说，日本突出报道这个新闻，也为自己向离台湾最近的与那国岛派兵找到了更多理由。另外，最近中美关系从僵持走向缓和，也是日本所不愿意看到的，冲绳也是美军战略利益重地，不排除日本也是借机为中美关系制造一些嫌隙。
中国社科院日本研究所研究员冯昭奎认为，日本民族最大的特点就是危机感强。其实，日本不应该对此事过于敏感。此事也反映出，中日之间还没有形成战略互信。中国国家主席*2008年访日时双方签署了第四个政治文件，规定“中日互为合作伙伴，互不构成威胁，相互支持对方的和平发展”。这个事情说明，对于这一共识没有很好落实。冯昭奎还认为，日美同盟仍在起遏制中国海军走出去的作用。中日美三国需要进一步通过对话和沟通加强互信
