* 1840年代鸦片战争后，中国被炮火打开国门，清政府被迫签订一系列不平等条约，基督教的传教活动亦被列入条约，传教士以此为护身符进入内地传教，基督教也随之进入中国。大批西方传教士以沿海通商口岸为基地迅速扩展基督教，建立教堂，同时也办立学校、医院、孤儿院等机构，基督教开始在中国获得了很多信徒。英国和美国宗派，如英国循道会，继续派遣传教士直到中华人民共和国成立后驱逐传教士。来自美国和英国的新教传教士在介绍中国方面的作用超过任何人。太平天国的起源就与传教活动有关。但相当部分传教士行为不端，所作所为远远超出传教的范围而成为侵略中国的西方国家的工具，引起了中国人对基督教的不满与仇恨。例如，1900年发生了义和团运动中，许多传教士拿起武器，参与巡逻和枪杀义和团，当然，也有很多传教士与基督徒被杀。又如，在八国联军入侵北京时，许多西方传教士也是烧杀抢掠的一员，趁火打劫，大发横财。
近代
由于基督教教义强调只能拜耶和华上帝，不能拜其他偶像，因此与"祭奠祖先"等很多中国传统习俗产生了很大抵触，使得基督教之前在中国一直没有得到很好的传播和发展，直到后来来中國传教的剛恆毅（1922年－1932年）与雷鸣远神父教宗解释中国人祭祖敬孔礼并不违背教会的信仰，中国人这么地做是为了向已亡的父母和祖先表达尊敬。教宗碧岳十二世因而在1939年12 月8日删除了祭祖敬孔的禁令，才解决了这一问题。（彭育申，2000）直到民国成立以后，中華民國臨時約法中保障了宗教自由，加上當時很多革命人士以及支持革命的人也是新教徒（例如： 孫文 、宋教仁、廖德山，以至後期的蔣中正和張學良等），因而在民國初期新教的發展比清朝時好。
1919 年巴黎和会对中華民國的不公，引发五四运动，之后也引发了一场从1922年到1927年间的“非基督教运动”。这场运动与义和团运动不同的是，主要参加者是激进知识青年。
1927 年南京國民政府成立，同年底蔣中正與宋美齡完婚，宋家是基督教家庭，蔣中正也為此受洗為基督徒，也成為中國史上第一位正式信奉上帝的領導人，由於國家領導人信奉的關係，新教在中華民國的發展變得相對寬鬆順利許多，甚至政府還給予某種程度的支援與鼓勵發展。
抗战时期，因为战争，男性都参军去，外国传教士被抓进集中营去，为了延续教会事工，中华圣公会决定在香港按立一位女性（李添嬡女士）成为牧师，然后派往澳門赴任，成为全世界第一位被按立的女性牧师。中华圣公会的决定引起当时全世界教会的反弹，因为过去女性从来没有担任过教会内任何重要职位。在普世圣公宗其他教省要求之下，该位女牧师被逼辞去牧师职位；另一方面，中华圣公会努力斡旋，陈明当时中国形势的险峻。最后，中华圣公会的决定终于得到普世圣公宗及其他教省的认同。
至中华人民共和国成立前夕，基督徒人数不到70万。
