同样令人不安的是，越来越多的迹象显示，中国已经把注意力转向日本——这里拥有几个世界上最大的海军与空军基地。一直以来，中国都在担心日本在两岸冲突中可能扮演的角色。特别值得注意的是，美国能够自由利用日本基地，将那里视为插手台海事务的跳板。在过去，关于日本对美国军事作战提供后勤支持一事，中国一直保持沉默。相比之下，最近解放军公开表示，导弹压制台湾的逻辑同样适用于美国驻日前线存在。中国导弹力量有选择性的破坏美军驻日前线基地部分关键设施之后，会向东京施压，以限制美国对海军基地的使用。美日两国密切关注这些理论发展，以免美日同盟对未来对华冲突准备不足。
目前，关于中国在亚洲的地区基地方面，台湾地区仍是中国大陆战略考量的重点。1996年，台湾危机期间，有证据显示，当时解放军很难监视美国所派遣两个航母战斗群的行动。值得注意的是，在这场发生在1996年3月的危机中，以日本横须贺为基地美军“独立”号航母(CV-62)是首艘到达台湾附近的航母，这使中国方面认为，在可能发生的对台冲突中，华盛顿政府很可能会派出驻扎在日本的航母。
中国领海外围区域的其他领土纠纷，也可能会遭到美国海军的干涉。因中日两国对台湾西北部钓鱼岛主权纠纷而出现的军事危机，可能会迫使美国采取行动。尽管有人怀疑日本决策层的某种迟疑(如是否对这些岛屿发动外部进攻)，可能会促使华盛顿政府履行防卫承诺，就像美日安全条约所规定的那样;而且，自2006年以来，不断举行的联合演习及军事演习表明，美国军队正在密切关注东中国的动态。再往南推进，中国对南中国海内大片水域的主权宣示，也可能会引发地区紧张。如果这种地区争斗升级为较大规模、威胁国际船动的的冲突，那么美国或许会下令其海军，维持这些海上航线的自由畅通。在这两种情况下，美国驻扎在日本的航母，以及亚洲海域附近的其他攻击群，可能会被命令首先采取反应。
然而，实际上，破坏亚洲稳定的具体领土纠纷，并不是美国海上力量威慑中国唯一原因。鉴于中国严重依赖经过马六甲海峡的海上能源运输供给，因此北京政府推测美国或许会试图封锁马六甲这一海上瓶颈来威胁中国。
此外，中国分析家也表达了对美国自封亚太地区保护着举动的众多不满。不过，长久以来地区冲突的爆发点，以及中国在海上领域的更加自信表明，北京政府正勉强接受美国的前沿存在，而这种存在会以比先前更快的速度遭到侵蚀。在中国对美国海军力量的矛盾心理日渐增强的情况下，美国在日本的基本部署便成为了被关注的重点。
