中国军事医学科学院微生物流行病研究所和北京地坛医院在研讨会发表的报告称：该药对甲型H1N1流感病毒具有明确的拮抗作用，疗效优于达菲。临床试验表明，连花清瘟胶囊的病毒核酸转阴时间与达菲相当，平均退热时间短于达菲，且治疗费用仅为达菲的八分之一。
军事医学科学院微生物流行病研究所采用三种不同的给药方式，分别测定治疗指数，结果显示，连花清瘟的治疗指数均高于达菲一倍左右。
国家中医药管理局甲型H1N1流感防治专家委员会委员、北京地坛医院中西医结合中心副主任王玉光提供的报告称，该院选取六十六例甲型H1N1流感患者，分别使用连花清瘟胶囊与达菲随机临床试验，结果显示：前者平均住院4.35天，达菲组4.60天；前者平均退热时间为2.13天，达菲为2.80天，统计学差异显著。在改善咽痛、咳嗽、咳痰等症状前者明显好于达菲组。
